曾有宦官对冯太后搬弄是非，谮说孝文帝的坏话。冯太后盛怒之下，又把孝文帝拓跋宏痛打了一顿。孝文帝默然接受，并不自明申辩。他对祖母太皇太后，没有丝毫的怨言与不满。也许是冯太后被孝文帝的态度感化了，也许是从未生养的冯太后对自己亲自抚养长大的孝文帝动了恻隐之心，此后她对孝文帝再也没有动过火气，而是以一个慈祥的祖母的身份培养、训导这位雅有至性的皇孙。

同样，孝文帝也逐渐感到祖母皇太后是那样的和蔼可亲，并且也为她临朝时那钢铁般的性格和无所畏惧的气度所威慑，对她产生了深深的敬佩与仰赖。正因如此，孝文帝逐渐成为冯太后得意的事业继承人。

由于冯太后的亲自教育与监督，孝文帝手不释卷，刻苦读书，日复一日，孜孜以求，不仅对儒家经典的精奥谙熟于心，而且史传百家，也无不涉猎，成了一位颇有才学的皇帝。据说他的诗赋文章皆即兴而作，立笔而就，即使有时因事情紧急，骑在马上口授章草，待其勒定成稿也不改一字，有大手笔之风度。

正在冯太后临朝称制，又于后宫之中精心培养孝文帝拓跋宏时，献文帝却在抓住机会，不甘心深居宫中，以太上皇名义对天下发号施令，重新培植自己的势力，这引起了冯太后的强烈不满和高度警觉。

天不可有二日，国不可有二君！大魏皇宫之中竟然存在着两个政权，而且这两个政权经常政见不合，岂不乱了国度？为了大魏的前途，也为了自身的安全考虑，更是为了扫清孝文帝亲政成为一代明君实行新政、革除弊端，冯太后暗下决心，必须除掉献文帝拓跋弘。

虽然冯太后一度视献文帝为已亲生，甚至凭一已之力，力挽狂澜，诛杀权臣乙浑，巩固献文帝的皇位，然而，献文帝不满太后临朝称制，处处与太后作对，暗中削弱冯太后的影响力，同时培植自己亲信，并诛杀了冯太后的精神依托李奕，这让冯太后感到心寒不已，母子之情已绝。

承明元年六月，朝廷突然宣布戒严，京师平凉气氛紧张，宫禁之中更是戒备森严。不久，太上皇应召前来晋谒冯太后，被伏兵一拥而上擒拿住，强行软禁起来。随后，冯太后将其鸩杀于平城永安殿。

冯太后得到冯熙的密报，言孝文帝的外祖父南郡王李惠，亦即献文帝的岳父，多次趁进宫之机，挑唆孝文帝与冯太后不合。冯太后闻得孝文帝不为所动，心中更是喜欢，。她相信自己这一次再也不会看错人了。

为绝后患，更是为了大权独揽，冯太后以谋叛罪诛杀了孝文帝的外祖父南郡王李惠。李惠的弟弟、儿子和妻子也同时被杀。为了清除隐患，冯太后不惜大开杀戒，以致因猜忌嫌疑被覆灭者十余家，死者数百人。